，在接下来的数百万年进化出许多不同的物种。海洋动物中，三叶虫受到了重创，并在下一次物种大灭绝事件中消亡。这就是造成46物种灭绝的物种大灭绝——石炭纪燃煤事件。

  古生代最后一个纪元是二叠纪，开始于29亿年前，结束于25亿年前。经过四千万年的发展，地球生物早已恢复了元气。降临者在石炭纪燃煤事件中看中了爬行动物的潜力，然而占据当时生物链顶级地位的霸主是哺乳动物的祖先，如丽齿兽丽，齿兽身长约35米，体重约300千克。丽齿兽第一种长出犬齿的动物，它的犬齿长达9厘米，锋利异常，且带有锯齿，奔跑时速达到100千米。而且它们的脑容量很大，成群活动。

  为了给他们看好的爬行动物腾出生存空间，降临者在西伯利亚地区引爆了地壳。一个直径五十公里的直通地幔的巨大缺口出现在地球上，这个超级火山一直喷发了数万年之久。流动着的岩浆覆盖了整个欧亚板块，并煮沸了海洋。这一时间内空气的湿度一直保持在80以上。而随着熔岩一起喷发出来的火山灰再次遮蔽了太阳，使地球陷入了40万年的漫漫长夜。

  二叠纪末发生的有史以来最严重的大灭绝事件，估计地球上有96的物种灭绝，其中95的海洋生物和75的陆地脊椎动物灭绝。三叶虫、海蝎以及重要珊瑚类群全部消失。陆栖的单弓类群动物和许多爬行类群也灭绝了。这次大灭绝使得占领海洋近3亿年的主要生物从此衰败并消失，让位于新生物种类，生态系统也获得了一次最彻底的更新，为恐龙类等爬行类动物的进化铺平了道路。