��军和红巨人将军奉命到神兽学校攻击神兵小将们，没想到在路上遇到泥石流，红巨人将军受伤失忆，幸得神兵小将们救了他，红巨人将军决定从此向善。

  铁面判官为了击败神兽学校，开启了恶人监狱，神兵小将们和各自的神兽合力粉碎了铁面判官的阴谋。

  布偶王子吩咐盖世太保找来冰总管，冰总管伪装成小偷进入神兽学校偷走了天晶兽的布偶，在南宫问天和东方铁心去找天晶兽的同时，盖世太保趁机抓走了南宫问雅。

  神兵小将们抓的抓、伤的伤，南宫问天将此归咎于自己，宽容将天晶兽恢复，大家一起前往营救南宫问雅。

  玉燕女王听说南宫问雅被抓了，准备去神兽之乡搭救。南宫问天等人循着踪迹寻找南宫问雅，冰总管突然出现，战斗随即展开。